Jonathan Medina es un futbolista profesional de PER y actualmente tiene 33 años. Forma parte de FC Cajamarca y lleva la camiseta número 3. Su función principal en el campo es Portero. Mide 189 cm y pesa 81 kg. Su pie más fuerte es Derecho. Su valoración de mercado estimada se sitúa actualmente en 50K €.

Su último traspaso lo llevó a FC Cajamarca desde UTC Cajamarca mediante el 2025-01-14.

En la temporada 2026 de la Liga 1 de Perú, Jonathan Medina jugó 1 partidos, con un promedio de 0 intercepciones, 0 entradas y 1 despejes por partido.