Markus Vaherna es un futbolista profesional de EST y actualmente tiene 27 años. Forma parte de Viimsi JK y lleva la camiseta número 99. Su función principal en el campo es Delantero. Su pie más fuerte es Ambos Pies.

Su último traspaso lo llevó a Viimsi JK desde JK Tabasalu mediante Fichaje Libre el 2025-02-26.

Durante la campaña 2025 de Esiliiga de Estonia, Markus Vaherna disputó 33 partidos, marcó 6 goles y dio 3 asistencias. Promedió 0.2 goles por partido con 0 tiros, de los cuales 0 fueron a puerta.