Saat ini ia membela Puebla dan mengenakan nomor punggung 13. Posisi utamanya di lapangan adalah sebagai Bek.

Selama Liga MX 2025-2026, Eduardo Navarro tampil dalam 20 pertandingan dengan rata-rata 1.1 tekel, 1.2 intersepsi, 3.2 sapuan, dan 0.1 blok tembakan per laga.